La temporada 16/17 comenzaba con dudas. Directiva nueva, cuerpo técnico nuevo, plantilla en su mayoría nueva y un inicio de temporada nada halagüeño. Pero el trabajo dió sus frutos, y se consiguió, hasta faltando pocas jornadas, pelear la liga gracias sobre todo a los resultados cosechados entre la Jornada 15 y 35.

En la Jornada 14 la Balompédica caía derrotada por 3 a 0 en la Ciudad Deportiva Andrés Iniesta de Albacete. El filial albaceteño se imponía sobre el césped a un Conquense que en ese momento peleaba a duras penas por la cuarta plaza con el Villarrubia y Quintanar del Rey.  El C.P. Villarrobledo y el C.D.Guadalajara  distanciaban al equipo blanquinegro en 7 y 8 puntos respectivamente en la tercera y segunda posición. Y el líder, C.F. Talavera disputaba otra competición  distanciando en 14 puntos a la Balompédica.

Desde aquella derrota, los blanquinegros enlazaban 15 jornadas sin perder. De la decimoquinta a la trigésima. 15 partidos en los que la balompédica conseguía 11 victorias y 4 empates, embolsándose 37 de los 45 y pegando un gran salto en la clasificación.

J15 UB Conquense 4- 1 CD Yuncos
J16 CD Atlético Tomelloso 1-1 UB Conquense
J17 UB Conquense 3-1 Mora CF
J18 Almagro CF 1-2 UB Conquense
J19 UB Conquense 2-0 Villarrubia CF
J20  UB Conquense 3-0 CF Talavera de la Reina
J21 CD Madridejos 1-4 UB Conquense
J22 UB Conquense 2-1 CD Azuqueca
J23 CD Toledo B 2-2 UB Conquense
J24 UB Conquense 3-1 CD Guadalajara
J25  CD Illescas 0-2 UB Conquense
J26 UB Conquense 3-3 CD Quintanar del Rey
J27 UD Almansa 0-2 UB Conquense
J28 UB Conquense 1-1 CP Villarrobledo
J29 CD Pedroñeras 1-2 UB Conquense

La derrota en Ciudad Real por 1-0 cortaba la racha de la Balompédica (Jornada 30). Una derrota aislada, ya que el Conquense volvería a encadenar 5 victorias consecutivas que asegurarían la participación en los playoff y posibilitaría la lucha por el campeonato hasta la penúltima jornada.

J31 UB Conquense 2 – 1 Atletico Tomelloso
J32 Yuncos 0 – 2 UBConquense
J33 UB Conquense 2 – 1 Albacete B
J34 Ud Carrión 1 – 3 UB Conquense
J35 UB Conquense 1 – 0 Marchamalo

Las derrotas en Mora y en casa frente al Almagro terminarían con las opciones de la Balompédica de luchar por el campeonato y dejarían al Conquense como subcampeón de liga y con la mente puesta en el ascenso.

El Conquense encaraba las eliminatorias de ascenso tras dos derrotas consiguiendo superar la primera frente al equipo Riojano de Anguiano con un doble empate en los dos partidos y que le valdría para clasificarse gracias al empate con goles conseguido en La Rioja. En la segunda eliminatoria el Conquense fué muy inferior al C.F.Peralada, y cayó eliminado de la lucha por el ascenso, en un estado de forma y juego lejano al de esos 15+5 partidos que hicieron posible la lucha por la liga.